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Folding@Home in docker

Descrizione

Folding@Home è un progetto di calcolo distribuito per aiutare la ricerca medica:

Simulazione del comportamento delle proteine (e non solo) relative a malattie degenerative, infettive e altro
Possibilità di selezionare, tramite l'interfaccia web, il tipo di ricerca da aiutare
Possibilità di usare sia la CPU che la GPU
Aiutare gli scienziati (di tutto il mondo) in modo indiretto

P.S è un progetto a cui tengo particolarmente, quindi anche se avete un computer vecchio che non usate, questo è il progetto giusto per renderlo di nuovo utile a tutti.

Struttura file e cartelle

/home/
└── ~/
    └── docker/
        └── folding@home/
            ├── data/
            ├── .env
            └── docker-compose.yml

data/ - la cartella dove risiedono i dati che servono a folding@home
.env - un file contenenti le variabili environment per il docker compose
docker-compose.yml - il docker compose per creare il container

Tutti i file e le cartelle devono essere creati a mano.

docker-compose

docker-compose.yml

version: "3"
services:
  fah:
    container_name: linuxserver-fah
    image: ghcr.io/linuxserver/foldingathome
    restart: unless-stopped
    ports:
      - ${FAH_PORT:-7396}:7396
    env_file: .env
    volumes:
      - ${FAH_DATA:-/home/docker/fah/data}:/config
    healthcheck:
      test: ["curl --silent --fail http://localhost:${FAH_PORT:-7396} || exit 1"]
      interval: 20s
      timeout: 10s
      retries: 3
      start_period: 10s

.env

# Generale
FAH_PORT=7396
FAH_DATA=/home/docker/fah/data

# Folding@Home
TZ=Europe/Amsterdam

Reverse proxy

Ancora non ho previsto l'uso di un reverse proxy. (Vedi Todo)

Aggiornamenti

Watchtower aggiorna l'immagine automaticamente.

Aggiornamento manuale:

docker-compose pull
docker-compose up -d
docker image prune

Backup e ripristino

Backup

Copiare a mano, tramite crontab o altro la cartella folding@home (Vedi Todo)

Ripristino

spegnere il container docker-compose down
cancellare l'intera cartella folding@home
dal backup copiare la cartella folding@home
far partire il container docker-compose up -d

Todo

Implementare:

reverse proxy: caddy o traefik.
backup: borg per fare i backup giornalieri completi.

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