MasterpieceDockerCompose/folding@home

Folding@Home

Descrizione

Folding@Home è un progetto di calcolo distribuito per aiutare la ricerca medica:

• Simulazione del comportamento delle proteine (e non solo) relative a malattie degenerative, infettive e molto altro
• Supporto al calcolo tramite CPU e/o GPU (la scelta è vostra)

P.S è un progetto a cui tengo particolarmente, quindi anche se avete un computer vecchio che non usate, questo è il progetto perfetto per renderlo di nuovo utile a tutti e per tutti

Struttura file e cartelle

/home/
└── docker/
    └── folding@home/
            ├── config/
            ├── .env
            └── docker-compose.yml

• config/ - cartella dove risiedono i dati che servono a folding@home
• .env - file contenenti le variabili environment per il docker-compose
• docker-compose.yml - file usato per creare il container

N.B. Tutti i file e le cartelle devono essere creati a mano

Esempi

Semplice esempio per iniziare ad usare subito il container

network

Con docker

docker network create custom-bridge

oppure usando podman

podman network create custom-bridge

docker-compose

docker-compose.yml

version: "3.5"
services:
  fah:
    container_name: linuxserver-fah
    image: lscr.io/linuxserver/foldingathome
    security_opt:
      - no-new-privileges:true
    networks:
      - custom-bridge
    restart: unless-stopped
    ports:
      - ${FAH_WEBUI_PORT:-7396}:7396
    env_file: .env
    volumes:
      - ${FAH_DATA:-/home/docker/folding@home/config}:/config
    healthcheck: # se modificate la porta dell'interfaccia web, ricordatevi di cambiarla anche qua sotto
      test: ["CMD", "curl", "-Ssf", http://localhost:7396"]
      interval: 1m30s
      timeout: 10s
      retries: 3
      start_period: 1m

networks:
  custom-bridge:
    name: custom-bridge
    driver: bridge

.env

# Generale
FAH_WEBUI_PORT=7396
FAH_DATA=/home/docker/fah/data

# Folding@Home
TZ=Europe/Amsterdam

Aggiornamento

Automatico

Usando watchtower il container si aggiorna automaticamente

Manuale

1. docker-compose up -d
2. docker image prune

Backup e ripristino

Backup

Usate borg per fare i backup giornalieri dell'intera cartella folding@home

Ripristino

Per una maggiore spiegazione sui passaggi da fare, controllate qua

1. fermare il container con docker-compose down
2. cancellare l'intera cartella folding@home
3. dal backup copiare la cartella folding@home
4. far ripartire il container con docker-compose up -d

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Licenza: CC BY-SA 4.0